“南京官（永乐）十八年，官属悉移北，南京六部所存惟礼、刑、工三部，各一侍郎，在南之官加‘南京’字于职衔上。上图明孝陵，康熙题“治隆唐宋”碑由于皇帝不在南京，故而南京不设内阁，”正统六年（1441），仍称南京官，比如，北京的政权核心是皇帝，而南京的核心由南京守备、协同守备和参赞机务等官组成，办公地点在南京中军都督府，称守备厅。
1、明朝的南京是陪都吗？为什么南京也有六部、都察院等中央部门？
明朝的两京制是继承了前代的制度。洪武初年曾以开封为“北京”，但在洪武十一年（1378）去掉开封的“北京”称号，改南京为京师，同时也停止了修建中都凤阳。洪武二十四年（1391）又遣太子去陕西“相宅”，欲都陕西，但因为太子巡抚陕西后不久薨逝，故而作罢。永乐元年（1403）改北平布政使司为北京，改北平府为顺天府，
永乐十九年（1421）正月正式定都北京，称北京为京师，原应天府为南京，称留都。明朝两京制与历史上的两京、多京制比较，自有其特点，《客座赘语》卷二《两都》条引户部郎中谢彬的话说：“商迁五都，不别置员。周营雒邑，惟命保厘，汉、唐旧邦，止设京兆。宋于西京，仅命留守，保厘、京兆，即今府尹是已。未闻两都并建六卿如也，
”这就是说明朝两京制一个重要的特点就是在留都也设有一套完整的中央机构。《明史·职官志》云：“南京官（永乐）十八年，官属悉移北，南京六部所存惟礼、刑、工三部，各一侍郎，在南之官加‘南京’字于职衔上，仁宗时补设官属，除‘南京’字。”正统六年（1441），仍称南京官，南京所设机构与北京相仿，也有五府、六部、九卿等衙门，品级与京也完全相同。
但既非京师，必然有区别于北京机构的特点，比如，北京的政权核心是皇帝，而南京的核心由南京守备、协同守备和参赞机务等官组成，办公地点在南京中军都督府，称守备厅。南京一切留守、防护之事均由这个核心统辖，南京守备多由公、侯、伯充任。成化二十三年（1487）后，南京参赞机务由兵部尚书专任，上图明孝陵南京既为留都，事关东南半壁江山，皇帝不放心交给几个公、侯、伯掌管，故在设置南京守备之后，于洪熙元年（1425）二月，设立守备太监。
表面上看，守备与守备太监是平行的，不相统属，但守备太监是“司礼监外差”，天子“三千里外亲臣”，所以守备虽以公、侯、伯之尊，也要屈尊俯首。守备厅会议在议事时，太监通常“据首席”，目的是保障南京权力核心不偏离整个国家的核心——皇帝。上图明孝陵，康熙题“治隆唐宋”碑由于皇帝不在南京，故而南京不设内阁，南京的官员定额也大大少于北京，责权也小于北京。
北京的中央机构掌管全国事务，南京中央机构多限于南京及南直隶地区，南京远离天子，行文多经北京相应机构转呈，不可避免的要受北京机构的制约。南京机构中有些纯属于框架式的，为了和北京“对称”，无任何职事，即使非框架式，也比较清闲，明朝后期，朝臣多结党，得势者居北京，失势者处南京，政局一翻转，则南北互调，所以南北两京官吏的调动，与时局密切相关。
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