93年，更名为南京医科大学。临床医学（八年制）、临床医学（5 3一体化）和口腔医学（五年制）三个专业其中外科学为国家重点学科，医学院临床医学学科进入全球排名前1%，是南京大学11个进入全球前1%的学科之一，当年南京医科大学希望和南京大学合并，可是南京大学看不上，尤其南京大学学生受不了当年分数比他们低一百多分的学生拿南京大学毕业证，就和南京医科大学骂战，后来南京大学想合并了，南京医科大学校方又反悔了。
星星高校专业那些事为您分析、分享、解惑南京大学是著名的世界一流建设大学，教育部直属的211/985重点建设大学。国家首批211重点建设大学，首批985建设大学，著名的c9之一，综合实力处于国内前列，但是他的临床医学怎么样？这要从过去和现在两方面分析，过去的时候，南京大学的医学院是国内一流，现在嘛，就比较一般了。
历史上的南京大学的临床医学那绝对是国内第一，为何这样说，咱冲南京大学的历史开始讲起，。南京大学在历史上是著名的国立中央大学，那实力国内第一，亚洲第一，世界零先，看经费。经费是第二名的一倍多，实力比当时的西南联合大学（清华大学 北京大学 南开大学）都厉害，当时医学水平也是国内顶级，为何这为何这样说，因为当时的南京大学医学院是中央大学医学院，实力国内第一，创立时名为国立第四中山大学医学院，当时南京大学叫第四国立中山大学（第一中山大学是中山大学，第二中山大学是浙江大学，第三中山大学是武汉大学，第四中山大学是南京大学，第五中山大学是河南大学）南京大学医学院中国创办的第一所国立大学医学院。
1928年5月更名为国立中央大学医学院，1932年独立为国立上海医学院，为当时中国唯一的国立医学院，后来陆续建立了了六大国立医学院，上海医学院也是6大国立医学院之首。抗战爆发后，学院内迁辗转迁至四川重庆，抗战胜利，学院迁回上海，于1952年更名为上海第一医学院。1985年，上海第一医学院定名为上海医科大学，后并入复旦大学，成为复旦大学上海医学院原校址由上海医学院援建师资，成立了重庆医科大学，
《国立上海医学院抗战时期旧址校门复建记》石碑矗立在重庆医科大学的《国立上海医学院抗战时期旧址校门复建记》石碑上铭刻：“公元一九五六年，上医响应国家号召，再度西进，溯江而上，倾半校之力，始创重庆医学院。上医重医，血脉相连，”也就是说当年中央大学医学院实力，是现在的复旦大学医学院 重庆医科大学。你说牛不牛，国立第一医学院绝对牛那现在南京大学医学院水平呢1987年经教育部（原国家教委）批准重建，成为教育部（原国家教委）第一所直属综合性大学长学制医学院（当时那几个厉害的医学院（上海医学院，中山医学院，协和医学院，同济医学院，华西医学院，湘雅医学院都是卫生部直属的，上海二医是上海市直属，首都医科大学是北京是高校，教育部没有厉害的医科院校）基础医学一级学科博士点、临床医学一级学科博士点和博士后流动站，口腔医学一级学科硕士点，护理学专业学位硕士点；本科专业：临床医学（八年制）、临床医学（5 3一体化）和口腔医学（五年制）三个专业其中外科学为国家重点学科，医学院临床医学学科进入全球排名前1%，是南京大学11个进入全球前1%的学科之一，
南京大学医学院附属鼓楼医院，南京大学医学院附属金陵医院（解放军南京总医院）南京大学医学院附属口腔医院，南京大学医学院附属仙林鼓楼医院（南京市仙林鼓楼医院）强不强看不出来，咱看教育部学科评估吧。很遗憾，，南京大学医学院2017，所有医学学科全部不参评。南京大学这个办法好，让大家摸不透自己的水平，但是南京大学2012年第三次学科评估参加了，咱看第三次。
2012年学科评估，看南京大学还是不错的，但是现在块10年过去了。不知道怎么了，国家重点临床专科排行国家重点临床专科数量，南京大学医学院有10个美全国排名28名，而南京医科大学有28个全国排名16名，，显然比较落后。具体分布，南京大学医学院附属鼓楼医院8个，南京大学医学院附属口腔医学院2个，国家医疗数据中心排行19个临床专业，南京大学没有一个学科进入前15名，南京医科大学只有1个进入前15名。
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