经过查询相关政策，试着自答一下。04年，《国务院关于深化改革严格土地管理制度的决定》明确规定，禁止擅自通过“村改居”等方式将农民集体所有的土地转为国有土地，04年以后，实行村改居的地方，将农民集体所有土地转为国有土地仍然要办理征地审批手续，实行不动产统一登记后，“村改居”后的不动产也应该按照“房地一体”登记的原则，在对土地权属进行调查认定的基础上，根据情况分两种情形办理。
1、农村“村改居”后，只有房屋所有权证没有土地证，怎么办土地证？
经过查询相关政策，试着自答一下：2004年，《国务院关于深化改革严格土地管理制度的决定》明确规定：禁止擅自通过“村改居”等方式将农民集体所有的土地转为国有土地。因此，2004年以后，实行村改居的地方，将农民集体所有土地转为国有土地仍然要办理征地审批手续，实行不动产统一登记后，“村改居”后的不动产也应该按照“房地一体”登记的原则，在对土地权属进行调查认定的基础上，根据情况分两种情形办理：2004年之前，依法通过“村改居”将集体土地转为国有土地，并颁发房屋所有权证的，提供土地审批的有关材料，直接办成国有土地的不动产权证。
2004年之后，“村改居”土地未经审批转为国有土地的，只能办理宅基地使用权或集体用地使用权的不动产权证，虽然都能取得不动产产权证，但是二者区别挺大。国有土地上的不动产可以上市交易，抵押等进行流转，而集体土地的不动产有所限制，只有个别试点省市可以上市交易，其他地市不允许抵押，只能在本集体经济组织之间，且符合条件的情况下转移。
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